همردیفی گلوبال   الگوریتم نیدلمن وانچ (Needleman–Wunsch algorithm) یک همترازی سراسری بر دو ترتیب متوالی مانند A و B انجام می‌دهد. معمولاً در بیوانفورماتیک برای همترازی توالی‌های پروتئینی یا نوکلئوتیدی کاربرد دارد. این الگوریتم در سال ۱۹۷۰ توسط سول نیدلمن و کریستین وانچ ارائه شد. این الگوریتم نمونه‌ای از برنامه‌ریزی پویا است و اولین کاربرد برنامه‌ریزی پویا در مقایسهٔ توالی‌های زیستی است. این الگوریتم را می توان برای هرجفت رشته ای به کار برد. در راهنمای زیر[…]

به نظرم چت جی پی تی جواب خوبی به این سوال داد my question Bioinformatics and systems biology are same? ChatGPT No, bioinformatics and systems biology are not the same. While they are related and often overlap in their applications, they have distinct focuses and methodologies. Bioinformatics is a field that combines biology, computer science, and statistics to analyze and interpret biological data. It involves the development and application of computational methods, algorithms, and tools for managing,[…]

به نظرم چت جی پی تی جواب خوبی به این سوال داد my question computational biology and systems biology are same? ChatGPT answer Computational biology and systems biology are related fields but they have distinct focuses and approaches. Computational biology refers to the use of computational methods, algorithms, and tools to analyze biological data, model biological systems, and solve biological problems. It involves the application of computer science, mathematics, and statistics to understand biological processes and systems.[…]

یکی از دلهره آورترین تصمیماتی که برنامه نویسان هنگام گرفتن یک پروژه جدید می گیرند انتخاب زبان برنامه نویسی مناسب است. Python و R بدون شک در هنگام انتخاب یک زبان برنامه نویسی برای یک پروژه علم داده (Data Science )از بهترین گزینه ها هستند. با گذشت سالها ، R و Python بازخوردهای مثبت زیادی را از طرف توسعه دهندگان و کاربران برای انواع کارهای مدرن به دست آورده اند. اگرچه در زمینه های خاصی مانند رایگان و منبع باز بودن با هم مشابه هستند، اما هر دو ویژگی‌ها و امکانات منحصر به فرد خود را دارند. چند[…]

یادگیری الگوریتم شاید یکی از قسمتهای سخت در برنامه نویسی باشد کتاب درک الگوریتم با زبانی روان این موضوع را توضیح میدهد. مترجم اجازه انتشار این کتاب را در نت داده اند و ما از ایشان تشکر میکنیم. برای دانلود کتاب اینجا را کلیک کنید. برای مشاهده فیلم معرفی کتاب اینجا را کلیک کنید.

بعد از سالها کار در این زمینه و مطالعه باز هم گفتن این حرف کمی برام سخته اما میگم…. “اگر زیست شناس هستید در رشته بیوانفورماتیک تحصیل نکنید و در رشته سیستم بیولوژی تحصیل کنید” البته این صحبت من بیشتر در ایران و کشورهایی که سیستم آموزشی مثل ایران دارند مثل هند صدق میکنه که عنوان رشته و محتوای آموزشی سخت و کمتر انعطاف پذیری دارند. این گفته من بیشتر به بحث فلسفه و افق دید این[…]

از سال 85 که شروع به نوشتن در وبلاگ بیوانفورماتیک کردم و بعد از یکسال یعنی سال 86 که این سایت را راه انداختم فراز و نشیب های عجیبی را در زندگی پشت سر گذاشتم.این سایت نیز فراز و نشیب های زیادی را پشت سر گذاشته است. همواره در این سالها گوشه ای از فکرم متوجه تولید محتوی و اشتراک گذاری آن با همه بوده است. برای چندمین بار سایت از دسترس خارج شد و خیلی چیزها[…]

شبکه تحقیقات پزشکی مولکولی وزارت بهداشت (صادر کننده گواهی های رسمی، آموزشی معتبر در کشور) در نظر دارد از تاریخ 15 لغایت 16 آذر ماه 94 کارگاه “مدل سازی پویا در زیست شناسی سامانه گرا (Dynamic Modelling in Systems Biology) ” را برگزار نماید. _ مقدمه و معرفی کاربردهای کارگاه : زیست شناسی سامانه‌ای یا Systems Biology یکی از جدیدترین مباحث زیست شناسی در سطح دنیا محسوب می شود. در این گرایش نوین، با استفاده از رویکرد[…]

کتاب “Analysis of Biological Networks” از انتشارات Wiley تحت عنوان “کاربرد شبکه ها در بيوانفورماتيک” توسط دکتر محی الدين جعفری از اعضای محترم انجمن بيوانفورماتيک ايران و عضو هيئت علمی انستيتو پاستور ايران ترجمه شده و به تازگی توسط انتشارات کيهان به چاپ رسيده است. جهت دريافت و خريد کتاب با شماره تلفنهای 09122991069 و 09195197802 و يا ايميل انجمن Info@ibis.org.ir تماس حاصل نماييد. دريافت فايل فهرست و عناوين کتاب حاضر