» نوشته ها

در این مقاله به صورت ساده به معرفی انواع شبکه های زیستی و فیچرهای مهم یک شبکه پرداخته است. از این جهت این مقاله مناسب میباشد که زبانی ساده دارد و برای کسانی که در آغاز راه یادگیری نتورکهای زیستی هستند میتواند کارگشا باشد. در ادامه مقاله به اهداف دارویی که توسط این روشها برای بیماری های وابسته به اعصاب صحبت کرده است.   برای دریافت مقاله اینجا را کلیک کنید. همچنین در ادامه تصاویری از دسته[…]

حدود 350 سال قبل از میلاد مسیح بود که ارسطو گفت “کل چیزی فراتر از جمع اجزا است” و گویا 2350 سال نیاز  بود تا بگذرد تا در دنیا بحث نگاه کل نگر به سیستم های زیسی داغ شود… امروزه سیستم بیولوژی سعی میکند با دو رویکرد “بالا به پایین” و “پایین به بالا” نگاهی سیستمی و کل نگر به سیستم های زیستی داشته باشد. نگاه کل نگر فقط به زیست شناسی محدود نمیشود بلکه در روانشاسی[…]

درس بیوانفورماتیک در آزمون دکتری وزارت بهداشت در رشته زیست پزشکی سامانه ای حدود 20 تا 30 سوال را شامل میشود. همچنین در کنکور دکتری وزارت علوم رشته زیست فناوری میکروبی یا همان بیوتکنولوژی میکروبی 10 سوال را شامل میشود. سالهای قبلتر در کنکور وزارت بهداشت در رشته بیوتکنولوژی پزشکی و پروتئومیکس کاربردی نیز از درس بیوانفورماتیک سوال طرح میشد که اکنون سوالی از این درس ندارند. تمام سوالات درس بیوانفورماتیک که در سالهای اخیر در ایران[…]

با موافقت انتشارات دکتر خلیلی نسخه کامل کتاب بیوانفورماتیک این انتشارات با نام کامل “بیوانفورماتیک سلولی و مولکولی” نوشته “بابک باباعباسی” به صورت کامل بر روی وبسایت قرار گرفت. برای مطالعه این کتاب میتوانید اینجا را کلیک کنید. این کتاب سعی کرده است همه جنبه های کاربرد بیوانفورماتیک در زیست شناسی را تا حد ممکن توضیح دهد. لیست مطالب این کتاب به شرح زیر میباشد فهرست مطالب عنوان                                                                                                                           صفحه فصل اول: مقدمه‌ای بر تکنولوژی‌های اُمیکس، بیوانفورماتیک و[…]

نگاه ما به نحوه حل مسائل خیلی مهم است.اگر بین انسانها توجه کنیم میبینیم که آدمهای مختلف راهکارهای مختلف برای حل مسائل دارند. حتی شیوه تفکر پزشکان و مهندسان و خیلی از کسب و کارهای دیگر با هم متفاوت هستند. یک استاد آمریکایی مقاله ای تحت عنوان “آیا یک زیست شناس میتواند یک رادیو را تعمیر کند” نوشته است. به نظرم از دو جهت مهم است اول از این که ببینیم رویکرد و مدل فکری زیست شناسها[…]

همردیفی گلوبال   الگوریتم نیدلمن وانچ (Needleman–Wunsch algorithm) یک همترازی سراسری بر دو ترتیب متوالی مانند A و B انجام می‌دهد. معمولاً در بیوانفورماتیک برای همترازی توالی‌های پروتئینی یا نوکلئوتیدی کاربرد دارد. این الگوریتم در سال ۱۹۷۰ توسط سول نیدلمن و کریستین وانچ ارائه شد. این الگوریتم نمونه‌ای از برنامه‌ریزی پویا است و اولین کاربرد برنامه‌ریزی پویا در مقایسهٔ توالی‌های زیستی است. این الگوریتم را می توان برای هرجفت رشته ای به کار برد. در راهنمای زیر[…]

به نظرم چت جی پی تی جواب خوبی به این سوال داد my question Bioinformatics and systems biology are same? ChatGPT No, bioinformatics and systems biology are not the same. While they are related and often overlap in their applications, they have distinct focuses and methodologies. Bioinformatics is a field that combines biology, computer science, and statistics to analyze and interpret biological data. It involves the development and application of computational methods, algorithms, and tools for managing,[…]

به نظرم چت جی پی تی جواب خوبی به این سوال داد my question computational biology and systems biology are same? ChatGPT answer Computational biology and systems biology are related fields but they have distinct focuses and approaches. Computational biology refers to the use of computational methods, algorithms, and tools to analyze biological data, model biological systems, and solve biological problems. It involves the application of computer science, mathematics, and statistics to understand biological processes and systems.[…]

یکی از دلهره آورترین تصمیماتی که برنامه نویسان هنگام گرفتن یک پروژه جدید می گیرند انتخاب زبان برنامه نویسی مناسب است. Python و R بدون شک در هنگام انتخاب یک زبان برنامه نویسی برای یک پروژه علم داده (Data Science )از بهترین گزینه ها هستند. با گذشت سالها ، R و Python بازخوردهای مثبت زیادی را از طرف توسعه دهندگان و کاربران برای انواع کارهای مدرن به دست آورده اند. اگرچه در زمینه های خاصی مانند رایگان و منبع باز بودن با هم مشابه هستند، اما هر دو ویژگی‌ها و امکانات منحصر به فرد خود را دارند. چند[…]