» بانکها، ابزارها و وبسایتهای معتبر در زمینه بیوانفورماتیک

۱۰۰ وب‌سایت معتبر و شناخته‌شده در زمینه بیوانفورماتیک در این صفحه معرفی شده اند. این وب‌سایت‌ها نه‌تنها در ارائه ابزارها و داده‌های مرتبط با بیوانفورماتیک نقش حیاتی ایفا کرده‌اند، بلکه به گسترش تحقیقات علمی در سطح جهانی کمک کرده و همچنین فرآیند یادگیری و آموزش را برای محققان تسهیل نموده‌اند. این منابع می‌توانند به عنوان مرجعی کلیدی برای پژوهشگران در تمامی سطوح علمی و دانشگاهی مورد استفاده قرار گیرند.

1. NCBI BLAST – blast.ncbi.nlm.nih.gov
   BLAST یکی از ابزارهای معروف برای جستجوی توالی‌های مشابه است و به پژوهشگران این امکان را می‌دهد تا توالی‌های ژنتیکی را با پایگاه‌های داده مقایسه کنند و شباهت‌های توالی را بررسی کنند.
2. HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC) – genenames.org
   HGNC به تعیین و استانداردسازی نام‌های ژن‌ها اختصاص دارد و همچنین پایگاه داده‌ای برای جستجوی نام‌های ژن و ویژگی‌های مربوط به آن‌ها فراهم می‌کند.
3. Eukaryotic Promoter Database (EPD) – epd.epfl.ch
   EPD یک سایت بیوانفورماتیکی و پایگاه داده‌ای برای توالی‌های پروموتری در یوکاریوت‌ها است و ابزارهایی برای شناسایی و تحلیل پروموترها در ژنوم‌های مختلف ارائه می‌دهد.
4. Phylogeny.fr – phylogeny.fr
   این وب‌سایت به ارائه ابزارهایی برای ساخت و تحلیل درخت‌های فیلوژنتیک اختصاص دارد و همچنین به محققان کمک می‌کند تا روابط تکاملی بین گونه‌ها را بررسی کنند.
5. EMBL-EBI Metagenomics – ebi.ac.uk/metagenomics
   این پایگاه داده به تحلیل داده‌های متاژنومیک اختصاص دارد و ابزارها و منابعی برای مطالعه تنوع میکروبی و تعاملات میکروبی فراهم می‌کند.
6. miRBase – mirbase.org
   miRBase پایگاه داده‌ای برای توالی‌های miRNA است و به پژوهشگران امکان می‌دهد تا توالی‌ها و ویژگی‌های miRNA را جستجو و تحلیل کنند.
7. OMIM – omim.org
   OMIM پایگاه داده‌ای برای اختلالات ژنتیکی و بیماری‌های انسانی است و اطلاعات گسترده‌ای در مورد ژن‌ها و اختلالات ژنتیکی مرتبط با آن‌ها ارائه می‌دهد.
8. CRISPRdb – crispr.i2bc.paris-saclay.fr
   این پایگاه داده به اطلاعات مربوط به سیستم CRISPR اختصاص دارد و ابزارهایی برای شناسایی و تحلیل توالی‌های CRISPR و پروتئین‌های مرتبط فراهم می‌کند.
9. GTEx Portal – gtexportal.org
   GTEx Portal به ارائه داده‌های بیان ژنی در بافت‌های مختلف بدن انسان اختصاص دارد و همچنین ابزارهایی برای تحلیل و تجزیه و تحلیل داده‌های بیان ژنی فراهم می‌کند.
10. CATH – cathdb.info
    CATH پایگاه داده‌ای برای ساختارهای سه‌بعدی پروتئین‌ها است و به پژوهشگران این امکان را می‌دهد تا طبقه‌بندی ساختارهای پروتئینی و ویژگی‌های ساختاری آن‌ها را مطالعه کنند.
11. SUPERFAMILY – superfam.org
    این پایگاه داده به طبقه‌بندی و تحلیل خانواده‌های پروتئینی و دامنه‌های ساختاری اختصاص دارد و ابزارهایی برای پیش‌بینی ویژگی‌های ساختاری پروتئین‌ها فراهم می‌کند.
12. PDBsum – pdbsum.org
    PDBsum یک سایت بیوانفورماتیکی و یک منبع مفید برای تحلیل و بررسی ساختارهای پروتئینی است و به محققان خلاصه‌ای از ویژگی‌های ساختاری و بیوشیمیایی پروتئین‌ها ارائه می‌دهد.
13. RCSB PDB – rcsb.org
    RCSB PDB یکی از پایگاه‌های اصلی برای ساختارهای سه‌بعدی پروتئین‌ها و نانوذرات زیستی است و ابزارهایی برای تجزیه و تحلیل ساختارهای بیولوژیکی فراهم می‌کند.
14. IMG – img.jgi.doe.gov
    IMG پایگاه داده‌ای برای داده‌های متاژنومیک و ژنومیک است که ابزارهایی برای تحلیل و مقایسه داده‌های ژنومی و متاژنومیک فراهم می‌کند.
15. Genomic Data Commons (GDC) – gdc.cancer.gov
    GDC به‌عنوان یک پایگاه داده جامع برای داده‌های ژنومی سرطان شناخته می‌شود و به پژوهشگران امکان می‌دهد داده‌های مربوط به سرطان را جستجو و تحلیل کنند.
16. PhosphoSitePlus – phosphosite.org
    این پایگاه داده به شناسایی و تحلیل مکان‌های فسفوریلاسیون در پروتئین‌ها اختصاص دارد و اطلاعات دقیقی در مورد اصلاحات پس از ترجمه ارائه می‌دهد.
17. ArrayExpress – ebi.ac.uk/arrayexpress
    ArrayExpress پایگاه داده‌ای برای داده‌های میکروآرایه و سایر تکنیک‌های بیان ژنی است و ابزارهایی برای جستجو و تحلیل داده‌های بیان ژنی فراهم می‌کند.
18. Human Protein Atlas – proteinatlas.org
    این وب‌سایت اطلاعات گسترده‌ای در مورد بیان و توزیع پروتئین‌ها در بافت‌های انسانی ارائه می‌دهد و به پژوهشگران کمک می‌کند تا اطلاعات پروتئینی را در زمینه‌های مختلف بررسی کنند.
19. COSMIC – cancer.sanger.ac.uk/cosmic
    COSMIC پایگاه داده‌ای برای جهش‌های سرطان و اطلاعات ژنومی مرتبط با آن‌ها است و به تحلیل داده‌های ژنومی سرطان کمک می‌کند.
20. PANTHER – pantherdb.org
    PANTHER پایگاه داده‌ای برای طبقه‌بندی و تحلیل ژن‌ها و پروتئین‌ها است و ابزارهایی برای پیش‌بینی عملکرد و طبقه‌بندی پروتئین‌ها فراهم می‌کند.
21. Pfam – pfam.xfam.org
    Pfam یکی از پایگاه‌های اصلی برای مطالعه خانواده‌های پروتئینی و دامنه‌های ساختاری است و ابزارهایی برای پیش‌بینی و تحلیل دامنه‌های پروتئینی ارائه می‌دهد.
22. MEROPS – ebi.ac.uk/merops
    MEROPS پایگاه داده‌ای برای پروتئازها و مهارکننده‌های آن‌ها است و اطلاعات گسترده‌ای در مورد عملکرد و ساختار این آنزیم‌ها فراهم می‌کند.
23. KOBAS – kobas.cbi.pku.edu.cn
    KOBAS ابزارهایی برای تحلیل و پیش‌بینی مسیرهای بیوشیمیایی و شبکه‌های متابولیکی فراهم می‌کند و به مطالعه عملکرد ژن‌ها و پروتئین‌ها در سیستم‌های زیستی کمک می‌کند.
24. GeneMANIA – genemania.org
    GeneMANIA به‌عنوان ابزاری برای پیش‌بینی تعاملات ژن‌ها و پروتئین‌ها شناخته می‌شود و به پژوهشگران امکان می‌دهد شبکه‌های ژنومی و پروتئینی را تحلیل کنند.
25. Clustal Omega – ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo
    این ابزار یک سایت بیوانفورماتیکی برای هم‌تراز کردن چندگانه توالی‌های پروتئینی و DNA استفاده می‌شود و به تحلیل و مقایسه توالی‌های زیستی کمک می‌کند.
26. T-Coffee – tcoffee.org
    T-Coffee ابزاری برای هم‌تراز کردن توالی‌ها است و به‌عنوان یک پلتفرم برای تحلیل توالی‌های بیولوژیکی و پیش‌بینی ساختارهای پروتئینی مورد استفاده قرار می‌گیرد.
27. MEME Suite – meme-suite.org
    MEME Suite به شناسایی الگوهای توالی‌های DNA و پروتئین‌ها اختصاص دارد و ابزارهایی برای پیش‌بینی و تحلیل موتیف‌ها و الگوهای توالی فراهم می‌کند.
28. PhyML – phylogeny.lirmm.fr/phyml
    PhyML ابزاری برای ساخت و تحلیل درخت‌های فیلوژنتیک است و به پژوهشگران امکان می‌دهد تا روابط تکاملی بین گونه‌ها را مدل‌سازی کنند.
29. ModBase – modbase.compbio.ucsf.edu
    ModBase پایگاه داده‌ای برای مدل‌های ساختاری پروتئین‌ها است و ابزارهایی برای پیش‌بینی و تحلیل ساختارهای پروتئینی فراهم می‌کند.
30. DAVID Bioinformatics Resources – david.ncifcrf.gov
    DAVID ابزارهایی برای تحلیل داده‌های زیستی و بیوانفورماتیکی فراهم می‌کند و به‌ویژه برای تحلیل داده‌های ژنومی و بیوشیمیایی استفاده می‌شود.
31. BiGG Models – bigg.ucsd.edu
    BiGG Models به مدل‌سازی و تحلیل شبکه‌های متابولیکی اختصاص دارد و به پژوهشگران کمک می‌کند تا مسیرهای متابولیکی و واکنش‌های بیوشیمیایی را مطالعه کنند.
32. MINT – mint.bio.uniroma2.it
    MINT پایگاه داده‌ای برای تعاملات پروتئینی است و به ارائه داده‌های مربوط به شبکه‌های تعاملی پروتئین‌ها اختصاص دارد.
33. PSLT – phylogeny.uconn.edu/pslt
    PSLT ابزارهایی برای تحلیل درخت‌های فیلوژنتیک و شبکه‌های تکاملی فراهم می‌کند و به پژوهشگران کمک می‌کند تا روابط بین گونه‌ها را بررسی کنند.
34. Arabidopsis Information Resource (TAIR) – arabidopsis.org
    TAIR پایگاه داده‌ای برای اطلاعات مربوط به Arabidopsis thaliana است و به پژوهشگران امکان می‌دهد تا داده‌های ژنتیکی و بیوشیمیایی این گیاه مدل را تحلیل کنند.
35. LocusZoom – locuszoom.org
    LocusZoom یک سایت بیوانفورماتیکی و ابزارهایی برای تجزیه و تحلیل داده‌های ژنومیک و نمایش نتایج تجزیه و تحلیل به‌صورت بصری فراهم می‌کند.
36. RNAcentral – rnacentral.org
    RNAcentral پایگاه داده‌ای برای توالی‌های RNA است و به محققان این امکان را می‌دهد تا اطلاعات مربوط به انواع مختلف RNA را جستجو و تحلیل کنند.
37. OrthoDB – orthodb.org
    OrthoDB پایگاه داده‌ای برای ژن‌های همولوگ و روابط تکاملی بین ژن‌ها است و ابزارهایی برای تحلیل و شناسایی ژن‌های همولوگ فراهم می‌کند.
38. UCSC Table Browser – genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables
    UCSC Table Browser ابزاری برای جستجو و استخراج داده‌های ژنومی از پایگاه داده UCSC Genome Browser است و به پژوهشگران امکان می‌دهد داده‌های ژنومیک را به‌صورت سفارشی تحلیل کنند.
39. WebLogo – weblogo.berkeley.edu
    WebLogo ابزاری برای ایجاد و تحلیل لوگوهای توالی است و به پژوهشگران کمک می‌کند تا الگوهای توالی DNA و پروتئین را بصری نمایند.
40. Primer3 – primer3.ut.ee
    Primer3 ابزاری برای طراحی پرایمرهای PCR است و به پژوهشگران کمک می‌کند تا پرایمرهای مناسب برای آزمایش‌های مولکولی طراحی کنند.
41. MEME – meme-suite.org/meme
    MEME ابزاری برای شناسایی و تحلیل موتیف‌های توالی DNA و پروتئین است و به پژوهشگران کمک می‌کند تا الگوهای خاص در توالی‌های بیولوژیکی را شناسایی کنند.
42. I-TASSER – zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER
    I-TASSER یک سایت بیوانفورماتیکی و ابزاری برای پیش‌بینی ساختارهای پروتئینی و مدل‌سازی ساختاری است و به تحلیل ساختار و عملکرد پروتئین‌ها کمک می‌کند.
43. GSEA – gsea-msigdb.org/gsea/index.jsp
    GSEA ابزاری برای تحلیل و شناسایی مسیرهای بیوشیمیایی و مجموعه‌های ژنی در داده‌های بیان ژنی است و به پژوهشگران امکان می‌دهد تا روندهای بیوشیمیایی را مدل‌سازی کنند.
44. SWISS-MODEL – swissmodel.expasy.org
    SWISS-MODEL ابزاری برای مدل‌سازی ساختاری پروتئین‌ها است و به پیش‌بینی و تحلیل ساختارهای پروتئینی بر اساس توالی‌های اولیه کمک می‌کند.
45. HMMER – hmmer.org
    HMMER ابزاری برای تحلیل و جستجوی توالی‌های بیولوژیکی با استفاده از مدل‌های مارکوف پنهان است و به شناسایی دامنه‌های پروتئینی و ساختارهای توالی کمک می‌کند.
46. MEME-ChIP – meme-suite.org/tools/meme-chip
    MEME-ChIP ابزارهایی برای تحلیل موتیف‌های توالی و داده‌های CHIP-Seq فراهم می‌کند و به شناسایی و تحلیل الگوهای توالی در داده‌های CHIP-Seq کمک می‌کند.
47. EVcouplings – evcouplings.org
    EVcouplings ابزاری برای مدل‌سازی و تحلیل تعاملات بین توالی‌های پروتئینی و پیش‌بینی ویژگی‌های ساختاری پروتئین‌ها است.
48. PHAST – phast.wishartlab.com
    PHAST یک سایت بیوانفورماتیکی و ابزاری برای تحلیل و پیش‌بینی ساختارهای توالی DNA و پروتئین است و به شناسایی و تحلیل موتیف‌های توالی کمک می‌کند.
49. iHOP – ihop-net.org/UniPub/iHOP
    iHOP پایگاه داده‌ای برای جستجو و مرور اطلاعات علمی از مقالات زیست‌پزشکی و بیولوژیکی است و به پژوهشگران کمک می‌کند تا اطلاعات مربوط به ژن‌ها و پروتئین‌ها را پیدا کنند.
50. DrugBank – drugbank.ca
    DrugBank پایگاه داده‌ای برای اطلاعات دارویی و تعاملات دارویی است و به پژوهشگران و داروسازان امکان می‌دهد تا اطلاعات دقیقی در مورد داروها و تعاملات آن‌ها کسب کنند.
51. DrugCentral – drugcentral.org
    DrugCentral به ارائه داده‌های جامع در مورد داروها، ترکیبات و مکانیزم‌های عمل داروها اختصاص دارد و ابزارهایی برای جستجو و تحلیل اطلاعات دارویی فراهم می‌کند.
52. RCSB Protein Data Bank Ligand Expo – ligand-expo.rcsb.org
    این پایگاه داده به تحلیل و بررسی لیگاندها و تعاملات آن‌ها با پروتئین‌ها اختصاص دارد و اطلاعات دقیقی در مورد لیگاندها و ساختارهای آن‌ها فراهم می‌کند.
53. ToxCast – epa.gov/chemical-research/toxicity-forecaster-toxcasttm-data
    ToxCast پایگاه داده‌ای برای ارزیابی سمیت مواد شیمیایی است و به پژوهشگران کمک می‌کند تا اطلاعات مربوط به اثرات سمی مواد شیمیایی را بررسی کنند.
54. Biomart – biomart.org
    Biomart ابزاری برای جستجو و تحلیل داده‌های بیولوژیکی و ژنومی است و به پژوهشگران امکان می‌دهد تا داده‌های مختلف را به‌طور یکپارچه جستجو و تحلیل کنند.
55. SwissADME – http://www.swissadme.ch
    SwissADME یک سایت بیوانفورماتیکی و یک ابزار آنلاین برای تحلیل خصوصیات فیزیکوشیمیایی و دارویی ترکیبات شیمیایی است. این پایگاه داده به پژوهشگران و توسعه‌دهندگان دارو کمک می‌کند تا ویژگی‌های مهمی مانند قابل جذب بودن، توزیع، متابولیسم، و حذف داروها را بررسی کنند. SwissADME به ویژه در مراحل اولیه توسعه دارو برای ارزیابی پتانسیل دارویی ترکیبات و پیش‌بینی ویژگی‌های بیولوژیکی آن‌ها کاربرد دارد.
56. VEGA ZZ – vegazz.net
    VEGA ZZ پایگاه داده‌ای برای آنالیز و مطالعه ساختارهای ژنومی و نقشه‌های کروموزومی است و ابزارهایی برای تجزیه و تحلیل داده‌های ژنومی فراهم می‌کند.
57. HapMap – sanger.ac.uk/resources/databases/hapmap.html
    HapMap پایگاه داده‌ای برای تنوع ژنتیکی انسان است و به تحلیل تنوع ژنتیکی و ارتباطات آن با ویژگی‌های مختلف انسانی کمک می‌کند.
58. TransFac – gene-regulation.com/pub/databases.html
    TransFac پایگاه داده‌ای برای اطلاعات مربوط به فاکتورهای رونویسی و تنظیمات ژنی است و ابزارهایی برای شناسایی و تحلیل فاکتورهای تنظیم‌کننده ژن فراهم می‌کند.
59. TIGER – bioinformatics.med.umich.edu/tiger
    TIGER پایگاه داده‌ای برای اطلاعات و تحلیل‌های ژنومیک است و به پژوهشگران ابزارهایی برای تحلیل داده‌های ژنومیک و مطالعه الگوهای ژنتیکی ارائه می‌دهد.
60. PROMO – alggen.lsi.upc.es
    PROMO ابزارهایی برای پیش‌بینی موتیف‌های فاکتورهای رونویسی و توالی‌های تنظیمی ارائه می‌دهد و به پژوهشگران کمک می‌کند تا الگوهای تنظیمی در توالی‌های DNA را شناسایی کنند.
61. TOPCONS – topcons.net
    TOPCONS ابزاری برای پیش‌بینی ساختارهای پروتئینی و ارزیابی عملکرد ساختاری توالی‌های پروتئینی است و به تحلیل ساختار و عملکرد پروتئین‌ها کمک می‌کند.
62. PolyPhen-2 – genetics.bwh.harvard.edu/pph2
    PolyPhen-2 یک سایت بیوانفورماتیکی و ابزاری برای پیش‌بینی تأثیرات غیرطبیعی تغییرات توالی پروتئین‌ها بر عملکرد پروتئین‌ها است و به شناسایی و تحلیل تغییرات ژنتیکی کمک می‌کند.
63. SwissLipids – swisslipids.org
    SwissLipids پایگاه داده‌ای برای اطلاعات مربوط به لیپیدها است و به پژوهشگران امکان می‌دهد تا داده‌های مربوط به ساختار و عملکرد لیپیدها را جستجو و تحلیل کنند.
64. ViralZone – viralzone.expasy.org
    ViralZone پایگاه داده‌ای برای اطلاعات مربوط به ویروس‌ها است و به ارائه داده‌های جامعی در مورد ویژگی‌های ویروس‌ها، ساختار و ویژگی‌های بیولوژیکی آن‌ها می‌پردازد.
65. UniHI – unihi.org
    UniHI پایگاه داده‌ای برای تعاملات پروتئینی و ژنومیک است و به ارائه اطلاعاتی در مورد تعاملات پروتئین‌ها و عملکردهای آن‌ها در سیستم‌های زیستی کمک می‌کند.
66. BRENDA – brenda-enzymes.org
    BRENDA پایگاه داده‌ای برای آنزیم‌ها است و اطلاعات دقیقی در مورد ویژگی‌ها، عملکردها و تنظیمات آنزیم‌ها ارائه می‌دهد و به تحلیل فعالیت‌های آنزیمی کمک می‌کند.
67. Ensembl – www.ensembl.org
    Ensembl پایگاه داده‌ای جامع برای داده‌های ژنومیک است که به ارائه اطلاعات دقیق درباره توالی‌های ژنومی، آنالیز ژن‌ها و ویژگی‌های بیولوژیکی می‌پردازد و ابزارهای پیشرفته‌ای برای جستجو و تحلیل داده‌ها فراهم می‌کند.
68. UniProt – www.uniprot.org
    UniProt پایگاه داده‌ای برای اطلاعات پروتئینی است و به ارائه داده‌های جامعی در مورد توالی‌ها، ساختارها و عملکردهای پروتئین‌ها اختصاص دارد و ابزاری برای تحلیل و مقایسه پروتئین‌ها فراهم می‌کند.
69. European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) – www.ebi.ac.uk
    EMBL-EBI یک سایت بیوانفورماتیکی و مجموعه‌ای از پایگاه‌های داده بیوانفورماتیکی و ابزارهای تحلیل را ارائه می‌دهد و به پژوهشگران کمک می‌کند تا داده‌های زیستی را جستجو، تحلیل و تفسیر کنند.
70. ExPASy – www.expasy.org
    ExPASy پایگاه داده‌ای برای تحلیل و تجزیه و تحلیل پروتئین‌ها و توالی‌های ژنومیک است و به ارائه ابزارهای پیشرفته برای شناسایی و تحلیل ویژگی‌های بیوشیمیایی و ساختاری پروتئین‌ها می‌پردازد.
71. UCSC Genome Browser – genome.ucsc.edu
    UCSC Genome Browser ابزاری برای مرور و تحلیل داده‌های ژنومیک است و به پژوهشگران امکان می‌دهد تا داده‌های ژنومی را به‌صورت بصری بررسی کنند و به داده‌های ژنومیک سفارشی دسترسی داشته باشند.
72. GenBank – www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank
    GenBank پایگاه داده‌ای برای توالی‌های DNA است و به ارائه داده‌های توالی ژنتیکی از موجودات مختلف می‌پردازد و ابزاری برای جستجو و تحلیل توالی‌های ژنومی فراهم می‌کند.
73. DNA Data Bank of Japan – www.ddbj.nig.ac.jp
    DDBJ پایگاه داده‌ای برای توالی‌های ژنومی است که به جمع‌آوری، ذخیره و توزیع داده‌های توالی DNA از سراسر جهان پرداخته و به پژوهشگران ابزارهایی برای جستجو و تحلیل داده‌ها ارائه می‌دهد.
74. Pfam – pfam.xfam.org
    Pfam پایگاه داده‌ای برای اطلاعات مربوط به دامنه‌های پروتئینی است و به شناسایی و تحلیل ساختارهای عملکردی و توالی‌های پروتئینی کمک می‌کند.
75. Protein Data Bank – www.rcsb.org/pdb
    PDB پایگاه داده‌ای برای اطلاعات ساختاری پروتئین‌ها و سایر مولکول‌های بیولوژیکی است و به ارائه داده‌های سه‌بعدی و ساختاری پروتئین‌ها و نوکلئوتیدها می‌پردازد.
76. National Center for Biotechnology Information – www.ncbi.nlm.nih.gov
    NCBI مرکز اصلی برای دسترسی به منابع بیوانفورماتیک و داده‌های زیستی است. این پایگاه شامل ابزارها و پایگاه‌های داده‌ای نظیر GenBank، PubMed و BLAST است که به پژوهشگران در جستجو، تحلیل و تفسیر داده‌های ژنتیکی و بیولوژیکی کمک می‌کند. NCBI به عنوان یک منبع جامع برای اطلاعات زیستی و ابزارهای تحقیقاتی در سطح جهانی شناخته می‌شود.
77. Bioconductor – bioconductor.org
    Bioconductor مجموعه‌ای از ابزارها و بسته‌های نرم‌افزاری برای تحلیل داده‌های زیستی و بیوانفورماتیک است و به پژوهشگران در زمینه تحلیل داده‌های ژنومی و پروتئینی کمک می‌کند.
78. GeneCards – www.genecards.org
    GeneCards سایتی برای اطلاعات ژن‌ها است و به ارائه داده‌های جامع و یکپارچه در مورد ژن‌ها، عملکردها و ویژگی‌های آن‌ها اختصاص دارد.
79. KEGG – www.kegg.jp
    KEGG ابزاری برای تحلیل و مدل‌سازی مسیرهای بیوشیمیایی و ژنومی است و به پژوهشگران کمک می‌کند تا شبکه‌های متابولیکی و مسیرهای بیوشیمیایی را تحلیل کنند.
80. Gene Expression Omnibus – www.ncbi.nlm.nih.gov/geo
    GEO سایتی برای داده‌های بیان ژنی است و به ارائه داده‌ها و ابزارهایی برای تحلیل داده‌های بیان ژنی کمک می‌کند.
81. Broad Institute – www.broadinstitute.org
    Broad Institute یک سایت بیوانفورماتیکی و مرکز تحقیقاتی پیشرفته‌ای است که به تحقیق و توسعه در زمینه ژنومیک و بیوانفورماتیک اختصاص دارد و ابزارهای نوآورانه‌ای برای تحلیل داده‌های زیستی ارائه می‌دهد.
82. InterPro – www.ebi.ac.uk/interpro
    InterPro پایگاه داده‌ای برای تحلیل و شناسایی دامنه‌ها و موتیف‌های پروتئینی است و به پژوهشگران کمک می‌کند تا ویژگی‌های ساختاری و عملکردی پروتئین‌ها را تحلیل کنند.
83. Swiss-Prot – www.uniprot.org/uniprot
    Swiss-Prot بخش تخصصی UniProt است که به ارائه داده‌های دقیق و اعتبارسنجی‌شده در مورد توالی‌ها و عملکرد پروتئین‌ها می‌پردازد و به پژوهشگران کمک می‌کند تا اطلاعات جامع‌تری درباره پروتئین‌ها به‌دست آورند.
84. Phytozome – phytozome.jgi.doe.gov
    Phytozome پایگاه داده‌ای برای داده‌های ژنومی گیاهان است و به پژوهشگران امکان می‌دهد تا توالی‌های ژنومی گیاهان مختلف را تحلیل و مقایسه کنند.
85. Bioinformatics.org – www.bioinformatics.org
    Bioinformatics.org پایگاه داده‌ای برای منابع و ابزارهای بیوانفورماتیکی است و به ارائه داده‌ها، ابزارها و آموزش‌های مرتبط با بیوانفورماتیک اختصاص دارد.
86. FlyBase – flybase.org
    FlyBase پایگاه داده‌ای برای اطلاعات ژنومی و بیولوژیکی در مورد Drosophila melanogaster است و به پژوهشگران کمک می‌کند تا داده‌های ژنومیک و بیولوژیکی این مدل حیوانی را تحلیل کنند.
87. WormBase – wormbase.org
    WormBase پایگاه داده‌ای برای اطلاعات ژنومی و بیولوژیکی در مورد Caenorhabditis elegans است و ابزارهایی برای تحلیل داده‌های ژنومی و بیولوژیکی این کرم ارائه می‌دهد.
88. ZFIN – zfin.org
    ZFIN پایگاه داده‌ای برای اطلاعات ژنومی و بیولوژیکی در مورد دوزیستان زبرا است و به پژوهشگران امکان می‌دهد داده‌های مربوط به ژن‌ها و ویژگی‌های بیولوژیکی این مدل حیوانی را بررسی کنند.
89. Rfam – rfam.org
    Rfam پایگاه داده‌ای برای اطلاعات در مورد RNA‌های غیرکدکننده است و به شناسایی و تحلیل موتیف‌های RNA و ساختارهای آن‌ها اختصاص دارد.
90. Gene Ontology Consortium – geneontology.org
    Gene Ontology Consortium پایگاه داده‌ای برای ارائه اصطلاحات و تعاریف مرتبط با توصیف عملکرد و ویژگی‌های ژن‌ها و پروتئین‌ها است و به پژوهشگران کمک می‌کند تا داده‌های بیولوژیکی را به‌طور استاندارد تحلیل کنند.
91. HomoloGene – www.ncbi.nlm.nih.gov/homologene
    HomoloGene ابزاری برای شناسایی ژن‌های همولوگ در گونه‌های مختلف.
92. Reactome – reactome.org
    Reactome ابزاری برای مسیرهای بیوشیمیایی و فرآیندهای سلولی است و به ارائه مدل‌های دقیق و ابزارهایی برای تحلیل مسیرهای بیوشیمیایی کمک می‌کند.
93. PANTHER – www.pantherdb.org
    PANTHER یک سایت بیوانفورماتیکی و پایگاه داده‌ای برای تحلیل و طبقه‌بندی پروتئین‌ها و ژن‌ها
94. SMART – smart.embl-heidelberg.de
    SMART پایگاه داده‌ای برای شناسایی و تحلیل دامنه‌های پروتئینی است. این ابزار به پژوهشگران کمک می‌کند تا ساختار و عملکرد دامنه‌های مختلف پروتئین‌ها را شناسایی و تحلیل کنند، و اطلاعات دقیقی درباره ویژگی‌های ساختاری پروتئین‌ها ارائه می‌دهد.
95. JASPAR – jaspar.genereg.net
    JASPAR پایگاه داده‌ای برای موتیف‌های تنظیمی و فاکتورهای رونویسی است. این ابزار به شناسایی و تحلیل توالی‌های تنظیمی در DNA کمک می‌کند و به پژوهشگران در پیش‌بینی تعاملات بین فاکتورهای رونویسی و DNA کمک می‌نماید.
96. BioGRID – thebiogrid.org
    BioGRID پایگاه داده‌ای برای تعاملات پروتئینی و ژنومی است. این ابزار اطلاعاتی درباره تعاملات پروتئینی و شبکه‌های بیولوژیکی ارائه می‌دهد و به تحلیل روابط بین پروتئین‌ها و ژن‌ها در سیستم‌های بیولوژیکی کمک می‌کند.
97. InParanoid – inparanoid.sbc.su.se
    InParanoid پایگاه داده‌ای برای شناسایی و تحلیل ژن‌های همولوگ و روابط تکاملی در بین گونه‌های مختلف است. این ابزار به پژوهشگران کمک می‌کند تا روابط تکاملی و همولوژی‌های بین ژن‌ها را تحلیل کنند.
98. TIGRFAMs – www.jcvi.org/cgi-bin/tigrfams/index.cgi
    TIGRFAMs پایگاه داده‌ای برای طبقه‌بندی و تحلیل خانواده‌های پروتئینی.
99. STRING – string-db.org
    STRING پایگاه داده‌ای برای تعاملات پروتئینی.
100. OMA – orthomcl.org
     OMA پایگاه داده‌ای برای تحلیل و شناسایی ژن‌های همولوگ و روابط تکاملی بین ژن‌ها.