» مدل سازی پویا در زیست شناسی سامانه گرا (Dynamic Modelling in Systems Biology)

شبکه تحقیقات پزشکی مولکولی وزارت بهداشت (صادر کننده گواهی های رسمی، آموزشی معتبر در کشور) در نظر دارد از تاریخ 15 لغایت 16 آذر ماه 94 کارگاه “مدل سازی پویا در زیست شناسی سامانه گرا (Dynamic Modelling in Systems Biology) ” را برگزار نماید.

_ مقدمه و معرفی کاربردهای کارگاه :

زیست شناسی سامانه‌ای یا Systems Biology یکی از جدیدترین مباحث زیست شناسی در سطح دنیا محسوب می شود. در این گرایش نوین، با استفاده از رویکرد کُل نگری (Holistic approach) در مقابل جزءنگری (Reductionism) و در نظر گرفتن اندرکنش های بین اجزا، موضوعات زیست شناسی به صورت سیستمیک تعریف می گردند. در واقع در این نوع نگاه، هر موجود زنده به صورت یک سامانه (System) معرفی گردیده و سعی می شود تا روابط بین اجزا این سامانه کشف و قوانین مرتبط با آنها مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفته و سرانجام مدلی از آن سامانه شبیه سازی گردد.
مبحث مدل سازی پویا یا دینامیک از گرایش های تخصصی در این حیطه است. در این گرایش فرایندهای زنده را به کمک دستگاه معادلات دیفرانسیل مدلسازی می کنند. این نحوه مدل سازی از جمله دقیق ترین روشها در پیشگویی رفتار موجود زنده است که کاربردهای فراوانی در صنعت کشف و ساخت داروها دارد.
با توجه به اینکه مبحث اشاره شده از موضوعات بسیار جدید و مطرح در دنیاست، ولی متأسفانه هنوز نتوانسته است جایگاهی در بین موسسات آموزشی/ پژوهشی و محققین بیابد. لذا برگزاری دوره های آشنایی برای محققین مرتبط با این حوزه ضروری می باشد. در همین راستا بعد از برگزاری اولین کارگاه نظری – عملی زیست شناسی سامانه‌ای در سطح کشوری با همکاری انستیتو پاستور ایران و پژوهشکده علوم زیستی پژوهشگاه دانش¬های بنیادی (IPM) در انستیتو پاستور ایران در سال 1393 که منجر به استقبال گسترده و برگزاری مجدد آن در همان سال شد، کارگاه مدل سازی پویا یا دینامیک که از مباحث تخصصی و پیشرفته در این حیطه است، برگزار می¬گردد. این کارگاه به کمک دو مدرس مدعو دیگر یکی از ایرانیان خارج از کشور در دانشگاه نیویورک و دیگری هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس برنامه ریزی شده است. سوابق علمی مدرسین در لینک های زیر آورده شده است:
https://www.researchgate.net/profile/Iman_Tavassoly
https://www.researchgate.net/profile/Mehdi_Mirzaie

_ اهداف کلی:

آشنایی با مفاهیم مدل سازی پویا در زیست شناسی سامانه ای و کاربردهای آنها همراه با کار عملی با نرم افزارهای مربوطه.

_ اهداف اختصاصی:

انتظار می رود شرکت کنندگان در کارگاه، با مفهوم و کاربرد مدل سازی پویا در زیست شناسی سامانه ای آشنا شده و در مورد نحوه ساخت، تجزیه و تحلیل مدلهای پویا مهارت بیابند.

_ سر فصل های کارگاه:

1) رویکردهای بالا-پایین و پایین-بالا در زیست شناسی سامانه گرا
(Approaches in Systems Biology)
2) کینتیک واکنش های بیوشیمیایی آنزیمی و تنظیم ژنی
(Biochemical and Regulatory Kinetics)
3) آشنایی با معادلات دیفرانسیل معمولی و دستگاه معادلات
(Ordinary Differential Equation)
4) حل معادلات دیفرانسیل معمولی و دستگاه معادلات در نرم افزار MATLAB
(ODE Solving by MATLAB)
5) تحلیل صفحه فاز و حالت پایا
(Steady State and Phase Plane Analysis )
6) تحلیل دوشاخه شدن و موتیف های شبکه
(Bifurcation Analysis and network motifs)
7) برازش پارامتری و استواری مدل
(Parameter fitting and Robustness)

_ گروه مخاطبین (گروه هدف):

اعضای هیئت علمی دانشگاه ها و مؤسسات پژوهشی کشور در رشته های مختلف علوم زیستی و پزشکی
دانشجویان تحصیلات تکمیلی در رشته های مختلف علوم زیستی و پزشکی
علاقه مندان به مباحث نوین زیست شناسی

زمان:
15 و 16 آذر 1394

محل برگزاری:
پژوهشگاه دانش های بنیادی

تلفن های ثبت نام:
66954324_021
64112449_021