هیچ چکیده‌ای موجود نیست زیرا‌این یک نوشته حفاظت شده است.

بخشی از سوالات کتاب تست بیوانفورماتیک(سوالات فصل دوم-هم ردیفی کتاب تست بیوانفورماتیک) ویزه کنکور دکتری زیست پزشکی سامانه ای و زیست فناوری پزشکی و زیست فناوری میکروبی را در زیر میبینید. با توجه به قرارداد عدم انتشار با انتشارات دکتر خلیلی از ارائه بیشتر سوالات به صورت آنلاین معذوریم. برای دریافت نسخه چاپی و به روز کتاب با انتشارات دکتر خلیلی تماس بگیرید. 02166568621   BLAST-1 انتخابی برای مقایسه کامل دو ژنوم متعلق به گونه‌های متفاوت: (دکتری[…]

هیچ چکیده‌ای موجود نیست زیرا‌این یک نوشته حفاظت شده است.

بخشی از سوالات کتاب تست بیوانفورماتیک(فصل یک-بانک‌های اطلاعات اولیه کتاب تست بیوانفورماتیک) ویزه کنکور دکتری زیست پزشکی سامانه ای و زیست فناوری پزشکی و زیست فناوری میکروبی را در زیر میبینید. با توجه به قرارداد عدم انتشار با انتشارات دکتر خلیلی از ارائه بیشتر سوالات به صورت آنلاین معذوریم. برای دریافت نسخه چاپی و به روز کتاب با انتشارات دکتر خلیلی تماس بگیرید. 02166568621 1-اگر در مطالعه‌ای هدف بررسی عملکرد یک ژن خاص باشد، کدام‌یک از شماره[…]

بیـوانفـورماتیک

(همراه با پاسخنامه تشریحی)

ویژه رشته‌های:

بیوتکنولوژی پزشکی- بیوتکنولوژی میکروبی- پروتئومیکس کاربردی-

زیست پزشکی سامانه‌ای

شرح فصل و نکات ویژه: در این فصل با مفاهیم پایه انفورماتیک آشنا می‌شوید. هدف از این فصل آشنایی زیست شناسان با مفاهیم انفورماتیک و آشنایی با انواع بانک‌های اطلاعاتی و زبان‌های برنامه‌نویسی می‌باشد. در این فصل زبانهای برنامه نویسی پر کاربرد در بیوانفورماتیک به صورت مختصر شرح داده می‌شوند. پیشنهاد مطالعاتی: کتاب “اولین گام در دنیای برنامه‌نویسی با PYTHON” نوشته “احمد معلی‌نژاد” کتابی است که با مفاهیم ساده زبان برنامه‌نویسی پایتون را آموزش می‌دهد. این کتاب[…]

شرح فصل و نکات ویژه: در این فصل به مفهوم تنوع ژنتیکی و روش‌های بررسی آن می‌پردازیم. پروژه‌ها و بانک‌های مربوط به SNPها در این فصل شرح داده می‌شوند. درخت‌های فیلوژنی و روش‌های رسم آن‌ها در این فصل شرح داده می‌شوند. پیشنهاد مطالعاتی: کتاب ”روش‌های آنالیز فیلوژنتیکی” نوشته ”سید محسن نساج حسینی” از انتشارات حق‌شناس کتاب جامع در زمینه تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی می‌باشد. 268-فصل سیزدهم  برای دریافت نسخه چاپی و به روز کتاب با انتشارات دکتر[…]

شرح فصل و نکات ویژه: در این فصل به معرفی الگوریتم‌ها و ابزارهایی که می‌توان در پیشگویی ساختاردوم و سوم پروتئین‌ها استفاده کرد می‌پردازیم. همواره پیشگویی با خطاهایی روبرو است. اما مسئله مهم این است که اگر اطلاعاتی از ساختار پروتئین مورد نظر داشته باشیم بهتر از این است که در مورد ساختار آن چیزی ندانیم. تلاش برای درک ساختار پروتئین‌ها باعث شده است تا روش‌ها و ابزارهای پیشگویی مداوم به روز شوند و ابزارهای قوی‌تری در[…]

شرح فصل و نکات ویژه: در این فصل به پیشگویی ساختار RNA و شرح مواردی در مورد RNAها می‌پردازیم. پیش‌بینی، مدل‌سازی و ترسیم ساختارهای دوم RNA. پیشگویی ساختار فضایی RNA توسط سه روش قابل انجام است. در این فصل به معرفی ابزارها و بانک‌های miRNA‌ها نیز می‌پردازیم. 229-کار با RNA و پیشگویی ساختار آن و معرفی بانک‌های miRNA    برای دریافت نسخه چاپی و به روز کتاب با انتشارات دکتر خلیلی تماس بگیرید. 02166568621   از جمله[…]

شرح فصل و نکات ویژه: در این فصل به مبحث متابولومیکس پرداخته می‌شود، و پایگاه‌های مسیرهای بيوشميايي و سیگنالیگ معرفی می‌شوند. شناسایی و مطالعه ي مسير‌هاي بيوشميايي هدف اصلی این فصل می‌باشد. اطلاعات مختلف ژنوميكس به ما در شناسايي مسير‌هاي ناشناخته و تكميل آن‌ها کمک می‌کند. 221-متابولومیکس    برای دریافت نسخه چاپی و به روز کتاب با انتشارات دکتر خلیلی تماس بگیرید. 02166568621   به بررسی متابولیت‌ها، متابولومیکس گفته می‌شود، به صورت دقیقتر می‌توانیم بگوییم تولید، جمع[…]

شرح فصل و نکات ویژه: در این فصل به مبحث ترنسکریپتومیکس یعنی آنالیز داده‌های بیان ژن پرداخته می‌شود. از جمله مباحثی که در این فصل بحث می‌شود شناسایی توالی‌های قابل رونویسی می‌باشد. روش‌هاي سنجش ميزان بيان ژن‌ها در این فصل شرح داده می‌شود. بررسی داده‌های بیان ژن در این فصل شرح داده می‌شود. در رابطه با بهینه‌سازی کدونی به منظور کلونینگ در این فصل توضیحاتی ارائه می‌شود. پیشنهاد مطالعاتی: مجموعه ”دروس بیوانفورماتیک” دکتر شریفی زارچی” در سایت[…]

شرح فصل و نکات ویژه: در این فصل به پروتئومیکس و تجزیه و تحلیل داده‌های آن می‌پردازیم. ایمونوانفورماتیک مبحث جدید و جذابی می‌باشد که در این فصل به آن خواهیم پرداخت. از جدیدترین وقایع حوزه علوم زیستی انجام پروژه پروتئوم انسان می‌باشد که مراکز مختلفی از نقاط مختلف دنیا در آن همکاری می‌کنند، از جمله پژوهشگاه رویان از ایران که پروژه پروتئوم کروموزوم Y را بر عهده دارد. حیطه‌های کارکردی ایمونوانفورماتیک در ایمونولوژی در این فصل شرح[…]

شرح فصل و نکات ویژه: در این فصل به مبحث کلاسیفیکشن دمین‌های پروتئینی و کلاس‌بندی پروتئین‌ها می‌پردازیم. بانک‌های اطلاعاتی ثانویه از اطلاعات بانک‌های اطلاعاتی اولیه استفاده می‌کنند. کلاسیفیکیشن دمین‌های پروتئین مبحث جذاب و پرکاربردی می‌باشد. در پروژه‌های ژنوم به منظور تجزیه و تحلیل‌داده‌های NGS از مباحث این فصل استفاده می‌شود. 145-بانک‌های اطلاعاتی ثانویه (کلاسیفیکیشن دمین‌های پروتئینی)    برای دریافت نسخه چاپی و به روز کتاب با انتشارات دکتر خلیلی تماس بگیرید. 02166568621   براساس تعریف عمومی دمین[…]

شرح فصل و نکات ویژه: در این فصل به مفاهیم پایه‌ای و کاربردی در رابطه با انواع هم‌ردیفی‌ها می‌پردازیم. هم‌ردیفی یا الایمنت کردن دو یا چند توالی با اهداف مختلفی در بیوانفورماتیک انجام می‌شود. یکی از چالش‌های بسیار مهم در بیوانفورماتیک هم‌ردیفی توالی‌ها می‌باشد. انواع BLAST و کاربردهای آن در این فصل شرح داده می‌شوند. 114-فصل ششم  برای دریافت نسخه چاپی و به روز کتاب با انتشارات دکتر خلیلی تماس بگیرید. 02166568621   بررسي و مقايسه توالي‌هاي[…]

شرح فصل و نکات ویژه:  در این فصل به Genome Warehouseها و بانک‌های اطلاعاتی ای که در رابطه با ارائه مقالات، کتب و … فعالیت می‌کنند می‌پردازیم.  مباحث این فصل کمک می‌کند تا بدانید نیازهای اولیه پژوهشی خود را در چه بانک‌هایی و به چه نحوی جست‌وجو کنید. Genome Warehouseها پایگاه‌هایی هستند که داده‌های ژنتیکی ارزشمندی را ارائه می‌دهند و تعدادی از مهم‌ترین پایگاه‌ها در این زمینه در این فصل معرفی می‌شوند. 92-فصل پنجم  برای دریافت نسخه[…]

شرح فصل و نکات ویژه: * در این فصل به بانک‌های اطلاعاتی ای که هدف خود را معطوف به توالی‌های اسیدآمینه کرده‌اند خواهیم پرداخت و همچنین بانک‌هایی معرفی می‌شوند که به ارائه ساختارهای سه بعدی پروتئین‌ها می‌پردازند. * بانک‌ها و ابزارهایی که معرفی می‌شوند را در اینترنت بازبینی کنید و با آن‌ها کار کنید. * ساختار سوم بسیاری از پروتئین‌ها که توسط روش‌های آزمایشگاهی کشف شده‌اند به صورت رایگان در بانک‌ها قابل دریافت می‌باشد. * بحث در[…]

شرح فصل و نکات ویژه: * در این فصل با بانک‌های اطلاعاتی اولیه که عموما حاوی داده‌های آزمایشگاهی شامل توالی‌های اسید نوکلئیک می‌باشند آشنا می‌شوید. * در این فصل به بانک‌های حاوی توالی اسید نوکلئیک میپردازیم و در فصل بعدی به بانک‌هایی که داده‌های اسیدآمینه را ارائه می‌دهند خواهیم پرداخت. * به بانک‌هایی که در این فصل معرفی شده‌اند مراجعه کنید و در آن‌ها جست‌وجو انجام دهید. 53-پایگاه‌های اطلاعات اولیه توالی‌های اسید نوکلئیک    برای دریافت نسخه[…]

شرح فصل و نکات ویژه: * در این فصل مروری کلی بر جنبه‌های مختلف ژنومیکس ساختاری، مقایسه‌ای و عملکردی خواهیم داشت. * مباحث مربوط به ژنومیکس مقایسه‌ای و عملکردی در فصل‌های بعد به تفصیل مورد بحث قرار می‌گیرند. * در این فصل انواع روش‌های سکئونسینگ و پروژه‌های ژنوم معرفی می‌شوند. بسیاری از مباحث موجود در این فصل در فصول بعدی با تفصیل شرح داده شده‌اند، به این دلیل برخی بخش‌ها در این فصل به صورت خلاصه تدوین[…]

شرح فصل و نکات ویژه: * در این فصل با بیوانفورماتیک، سیستم بیولوژی و حوزه های فعالیت آن‌‌ها آشنا می‌شوید. * مفهوم اُمیکس و انواع آن در این فصل آمده است. * حوزه کلینیکال بیوانفورماتیک در این فصل معرفی شده است. * شرح داده خواهد شد که انفورماتیک پزشکی متفاوت از بیوانفورماتیک است. زیست‌شناسی علم شناخت حیات است، این لغت از کلمه یونانی بیوس[1] به معنی زند    برای دریافت نسخه چاپی و به روز کتاب با[…]

بابک باباعباسی

پژوهشگاه رویان، پژوهشکده زیست‌شناسی و علوم پزشکی تولید مثل جهاد دانشگاهی،

مرکز تحقیقات پزشکی تولید مثل، گروه ژنتیک، تهران، ایران