رشته بیوانفورماتیک پزشکی که در سال 1400 در دبیرخانه شورای عالی برنامه ریزی علوم پزشکی وزارت بهداشت به تصویب رسیده بود امسال 1404 در کنکور کارشناسی ارشد وزارت بهداشت دانشجو میپذیرد https://hcmep.behdasht.gov.ir/Arshad_Payeh هنوز مشخص نیست کدام دانشگاههای علوم پزشکی به جذب دانشجو در این رشته میپردازند ولی به احتمال زیاد دانشگاه ایران و احتمالا دانشگاه علوم پزشکی تهران و علوم پزشکی اصفهان و شیراز پیشتاز خواهند بود.    

کتاب “Analysis of Biological Networks” از انتشارات Wiley تحت عنوان “کاربرد شبکه ها در بيوانفورماتيک” توسط دکتر محی الدين جعفری در سال 1394 به فارسی ترجمه شد و روانه بازار شد . همکنون از طریق لینک زیر میتوانید فایل پی دی اف کامل کتاب را به رایگان دانلود کنید… برای دانلود اینجا را کلیک کنید بی‌اغراق این کتاب را میتوان اولین کتاب مرجع به زبان انگلیسی دانست که با مطالعه دیگر کتب نوشته شده در این زمینه اهمیت[…]

نقشه راه بیوانفورماتیک و سیستم بیولوژی(بیولوژی محاسباتی) یک ارائه در رابطه با نقشه راه بیوانفورماتیک به همت انجمن زیست شناسی سلولی و مولکولی دانشگاه خوارزمی خواهم داشت که حول محور تصویر پیوست میباشد. اگر علاقه مند هستید شرکت کنید. “بیوانفورماتیک دان” بودن یا “بیوانفورماتیک کار” بودن مسئله این است!!!

طراحی و آنالیز شبکه در حوزه های مختلف علوم پر کاربرد میباشد و یکی از حوزه هایی که در آن شبکه ها کاربرد زیادی دارند زیست شناسی میباشد. این مقاله به رویکردهای تحقیقاتی در زمینه زیست شناسی شبکه میپردازد. این مقاله به صورت تخصصی به پنج حوزه میپردازد: area1:Inference and comparison of biological networks area2:Multimodal data integration and heterogeneous networks area3. Higher-order network analysis area4. Machine learning on networks area5. Network-based personalized medicine In more detail, we[…]

علم بیوانفورماتیک یکی از حوزه‌های میان رشته‌ای است که تمام دانشجویان، فارغ التحصیلان و فعالان حوزه زیست تحقیقاتی و دانش آموختگان علوم کامپیوتری و برنامه نویسی هم می‌توانند از آن بهره ببرند و یا در این حوزه ایفای نقش کنند. بیوانفورماتیک در واقعیت نقطه تلاقی بین دانش زیست‌شناسی و استفاده از داده‌ها، پایگاه‌های داده و کدنویسی است که موجب شناسایی بهتر و دقیق‌تر، پیشبینی فرآیندهای است که در سامانه‌های زیستی رخ می‌دهد. در نسخه اول نشریه علمی[…]

🔹🔹وب‌سایت Mordor Intelligence گزارش جامع و ارزشمندی از بازار بیوانفورماتیک و روند رشد آن در کشورهای مختلف منتشر کرده است. 🔹🔹 📈 بر اساس این گزارش، ارزش بازار خدمات بیوانفورماتیک در سال 2024 بالغ بر 16.36 میلیارد دلار برآورد شده است و پیش‌بینی می‌شود تا سال 2029 به 23.97 میلیارد دلار برسد. 🔍رشد سریع علوم پروتئومیکس و ژنومیکس و افزایش تقاضا برای توالی‌یابی اسید نوکلئیک و پروتئین، تحلیل داده و افزایش تحقیقات در زمینه زیست‌شناسی مولکولی و[…]

1-3R-programming-language-training-course-By-Babak-Babaabasi (2)R Data Structures: R’s basic data structures include the vector, list, matrix, data frame, and factors. Vectors A vector is simply a list of items that are of the same type. To combine the list of items to a vector, use the c() function and separate the items by a comma. In the example below, we create a vector variable called fruits, that combine strings: # Vector of strings fruits = c(“banana”, “apple”, “orange”) # Print[…]

R Notebook by: babak babaabasi R If … Else Conditions and If Statements   x = readline(prompt=”Enter an integer number: “) if(x>3) print(“Positive”) if(x<7) print(“negative”) Write the R script that take two integers as input and print out the larger number. A = as.numeric(readline(prompt=”Enter first numbera: “)) B = as.numeric(readline(prompt=”Enter second number: “)) if(A > B) print(A) if(B > A) print(B) x = as.integer(readline(prompt=”Enter an integer number: “)) if(x>0) print(“Positive”) else print(“Negative”) You can also run a[…]

R (programming language) training course. By:Babak Babaabasi (1)R Tutorial: Why Are There So Many Programming Languages? There are so many programming languages out there, and more are developed every few years. We have Python, JavaScript, PHP, C++, Ruby, Java, C#, and way too many more to list here. Here are some developer jobs and the main programming languages they use: Game developers use C++ or C# to make video games for PCs and consoles. Web developers use[…]

در این مقاله به صورت ساده به معرفی انواع شبکه های زیستی و فیچرهای مهم یک شبکه پرداخته است. از این جهت این مقاله مناسب میباشد که زبانی ساده دارد و برای کسانی که در آغاز راه یادگیری نتورکهای زیستی هستند میتواند کارگشا باشد. در ادامه مقاله به اهداف دارویی که توسط این روشها برای بیماری های وابسته به اعصاب صحبت کرده است.   برای دریافت مقاله اینجا را کلیک کنید. همچنین در ادامه تصاویری از دسته[…]

حدود 350 سال قبل از میلاد مسیح بود که ارسطو گفت “کل چیزی فراتر از جمع اجزا است” و گویا 2350 سال نیاز  بود تا بگذرد تا در دنیا بحث نگاه کل نگر به سیستم های زیسی داغ شود… امروزه سیستم بیولوژی سعی میکند با دو رویکرد “بالا به پایین” و “پایین به بالا” نگاهی سیستمی و کل نگر به سیستم های زیستی داشته باشد. نگاه کل نگر فقط به زیست شناسی محدود نمیشود بلکه در روانشاسی[…]

درس بیوانفورماتیک در آزمون دکتری وزارت بهداشت در رشته زیست پزشکی سامانه ای حدود 20 تا 30 سوال را شامل میشود. همچنین در کنکور دکتری وزارت علوم رشته زیست فناوری میکروبی یا همان بیوتکنولوژی میکروبی 10 سوال را شامل میشود. سالهای قبلتر در کنکور وزارت بهداشت در رشته بیوتکنولوژی پزشکی و پروتئومیکس کاربردی نیز از درس بیوانفورماتیک سوال طرح میشد که اکنون سوالی از این درس ندارند. تمام سوالات درس بیوانفورماتیک که در سالهای اخیر در ایران[…]

نسخه کامل کتاب”بیوانفورماتیک سلولی و مولکولی” نوشته “بابک باباعباسی” از طریق لینک زیر به صورت رایگان قابل دانلود میباشد:   برای دانلود اینجا را کلیک کنید     همچنین برای دسترسی راحتتر و غنی سازی وب فارسی برای مطالعه کتاب از لینکهای زیر میتوانید استفاده کنید.   فصل اول: مقدمه‌ای بر تکنولوژی‌های اُمیکس، بیوانفورماتیک و کلینیکال بیوانفورماتیک فصل دوم: ژنومیکس فصل سوم: پایگاه‌های اطلاعات اولیه توالی‌های اسید نوکلئیک فصل چهارم: پایگاه‌های اطلاعات اولیه توالی‌های اسید آمینه و ساختار فضایی پروتئین‌ها فصل[…]

نگاه ما به نحوه حل مسائل خیلی مهم است.اگر بین انسانها توجه کنیم میبینیم که آدمهای مختلف راهکارهای مختلف برای حل مسائل دارند. حتی شیوه تفکر پزشکان و مهندسان و خیلی از کسب و کارهای دیگر با هم متفاوت هستند. یک استاد آمریکایی مقاله ای تحت عنوان “آیا یک زیست شناس میتواند یک رادیو را تعمیر کند” نوشته است. به نظرم از دو جهت مهم است اول از این که ببینیم رویکرد و مدل فکری زیست شناسها[…]

همردیفی گلوبال   الگوریتم نیدلمن وانچ (Needleman–Wunsch algorithm) یک همترازی سراسری بر دو ترتیب متوالی مانند A و B انجام می‌دهد. معمولاً در بیوانفورماتیک برای همترازی توالی‌های پروتئینی یا نوکلئوتیدی کاربرد دارد. این الگوریتم در سال ۱۹۷۰ توسط سول نیدلمن و کریستین وانچ ارائه شد. این الگوریتم نمونه‌ای از برنامه‌ریزی پویا است و اولین کاربرد برنامه‌ریزی پویا در مقایسهٔ توالی‌های زیستی است. این الگوریتم را می توان برای هرجفت رشته ای به کار برد. در راهنمای زیر[…]

به نظرم چت جی پی تی جواب خوبی به این سوال داد my question Bioinformatics and systems biology are same? ChatGPT No, bioinformatics and systems biology are not the same. While they are related and often overlap in their applications, they have distinct focuses and methodologies. Bioinformatics is a field that combines biology, computer science, and statistics to analyze and interpret biological data. It involves the development and application of computational methods, algorithms, and tools for managing,[…]

به نظرم چت جی پی تی جواب خوبی به این سوال داد my question computational biology and systems biology are same? ChatGPT answer Computational biology and systems biology are related fields but they have distinct focuses and approaches. Computational biology refers to the use of computational methods, algorithms, and tools to analyze biological data, model biological systems, and solve biological problems. It involves the application of computer science, mathematics, and statistics to understand biological processes and systems.[…]

یکی از دلهره آورترین تصمیماتی که برنامه نویسان هنگام گرفتن یک پروژه جدید می گیرند انتخاب زبان برنامه نویسی مناسب است. Python و R بدون شک در هنگام انتخاب یک زبان برنامه نویسی برای یک پروژه علم داده (Data Science )از بهترین گزینه ها هستند. با گذشت سالها ، R و Python بازخوردهای مثبت زیادی را از طرف توسعه دهندگان و کاربران برای انواع کارهای مدرن به دست آورده اند. اگرچه در زمینه های خاصی مانند رایگان و منبع باز بودن با هم مشابه هستند، اما هر دو ویژگی‌ها و امکانات منحصر به فرد خود را دارند. چند[…]